Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms