Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRF9Q00978 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms