Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC5P78333 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC5P78333 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC5P78333 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC5P78333 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC5P78333 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC5P78333 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC5P78333 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC5P78333 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC5P78333 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC5P78333 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC5P78333 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC5P78333 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC5P78333 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC5P78333 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC5P78333 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC5P78333 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC5P78333 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC5P78333 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC5P78333 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC5P78333 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC5P78333 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC5P78333 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPC5P78333 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPC5P78333 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GPC5P78333 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPC5P78333 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPC5P78333 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPC5P78333 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPC5P78333 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPC5P78333 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPC5P78333 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC5P78333 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC5P78333 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC5P78333 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC5P78333 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC5P78333 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC5P78333 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC5P78333 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC5P78333 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC5P78333 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC5P78333 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC5P78333 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC5P78333 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC5P78333 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC5P78333 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC5P78333 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC5P78333 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC5P78333 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC5P78333 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC5P78333 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC5P78333 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC5P78333 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC5P78333 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC5P78333 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC5P78333 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC5P78333 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC5P78333 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC5P78333 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC5P78333 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC5P78333 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC5P78333 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC5P78333 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC5P78333 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC5P78333 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC5P78333 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC5P78333 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC5P78333 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC5P78333 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC5P78333 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC5P78333 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC5P78333 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC5P78333 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC5P78333 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC5P78333 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC5P78333 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC5P78333 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC5P78333 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC5P78333 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC5P78333 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC5P78333 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC5P78333 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC5P78333 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC5P78333 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC5P78333 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC5P78333 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC5P78333 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC5P78333 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC5P78333 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC5P78333 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC5P78333 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC5P78333 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC5P78333 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC5P78333 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC5P78333 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC5P78333 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC5P78333 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPC5P78333 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPC5P78333 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPC5P78333 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
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