Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLR2LP62875 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2LP62875 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms