Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCALDP61601 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCALDP61601 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCALDP61601 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCALDP61601 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCALDP61601 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCALDP61601 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCALDP61601 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCALDP61601 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCALDP61601 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCALDP61601 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCALDP61601 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCALDP61601 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCALDP61601 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCALDP61601 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCALDP61601 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCALDP61601 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NCALDP61601 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCALDP61601 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCALDP61601 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCALDP61601 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCALDP61601 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCALDP61601 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCALDP61601 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCALDP61601 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCALDP61601 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCALDP61601 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCALDP61601 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCALDP61601 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCALDP61601 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCALDP61601 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCALDP61601 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCALDP61601 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCALDP61601 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCALDP61601 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCALDP61601 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCALDP61601 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCALDP61601 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCALDP61601 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCALDP61601 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCALDP61601 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCALDP61601 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCALDP61601 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCALDP61601 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCALDP61601 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCALDP61601 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCALDP61601 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCALDP61601 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCALDP61601 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCALDP61601 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCALDP61601 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCALDP61601 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCALDP61601 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCALDP61601 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCALDP61601 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCALDP61601 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCALDP61601 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCALDP61601 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCALDP61601 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCALDP61601 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCALDP61601 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCALDP61601 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCALDP61601 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NCALDP61601 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCALDP61601 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCALDP61601 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCALDP61601 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NCALDP61601 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCALDP61601 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCALDP61601 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCALDP61601 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCALDP61601 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCALDP61601 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCALDP61601 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCALDP61601 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCALDP61601 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCALDP61601 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCALDP61601 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCALDP61601 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCALDP61601 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCALDP61601 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NCALDP61601 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCALDP61601 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCALDP61601 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCALDP61601 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCALDP61601 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCALDP61601 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCALDP61601 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCALDP61601 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCALDP61601 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCALDP61601 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCALDP61601 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCALDP61601 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCALDP61601 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCALDP61601 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCALDP61601 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCALDP61601 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCALDP61601 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCALDP61601 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCALDP61601 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms