Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-16P61578 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms