Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAP25P60880 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms