Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ROMO1P60602 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms