Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms