Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB15P59190 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB15P59190 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB15P59190 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB15P59190 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB15P59190 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB15P59190 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB15P59190 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB15P59190 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB15P59190 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB15P59190 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB15P59190 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB15P59190 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB15P59190 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB15P59190 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB15P59190 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB15P59190 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB15P59190 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB15P59190 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB15P59190 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB15P59190 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB15P59190 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB15P59190 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB15P59190 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB15P59190 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB15P59190 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB15P59190 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB15P59190 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB15P59190 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB15P59190 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB15P59190 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB15P59190 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB15P59190 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB15P59190 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB15P59190 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB15P59190 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB15P59190 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB15P59190 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB15P59190 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB15P59190 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB15P59190 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB15P59190 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB15P59190 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB15P59190 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB15P59190 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB15P59190 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB15P59190 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB15P59190 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB15P59190 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB15P59190 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB15P59190 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB15P59190 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB15P59190 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB15P59190 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB15P59190 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB15P59190 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB15P59190 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB15P59190 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB15P59190 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB15P59190 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB15P59190 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB15P59190 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB15P59190 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB15P59190 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB15P59190 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB15P59190 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB15P59190 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB15P59190 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB15P59190 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB15P59190 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB15P59190 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB15P59190 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB15P59190 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB15P59190 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB15P59190 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB15P59190 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB15P59190 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB15P59190 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB15P59190 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB15P59190 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB15P59190 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB15P59190 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB15P59190 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB15P59190 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB15P59190 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB15P59190 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB15P59190 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB15P59190 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB15P59190 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB15P59190 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB15P59190 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB15P59190 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB15P59190 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB15P59190 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB15P59190 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB15P59190 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB15P59190 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB15P59190 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB15P59190 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB15P59190 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms