Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms