Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BGRP55822 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms