Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELLP55199 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELLP55199 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELLP55199 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELLP55199 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELLP55199 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELLP55199 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELLP55199 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ELLP55199 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ELLP55199 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELLP55199 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELLP55199 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELLP55199 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELLP55199 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ELLP55199 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ELLP55199 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELLP55199 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELLP55199 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELLP55199 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELLP55199 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELLP55199 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELLP55199 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELLP55199 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELLP55199 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELLP55199 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELLP55199 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELLP55199 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELLP55199 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELLP55199 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELLP55199 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELLP55199 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELLP55199 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELLP55199 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELLP55199 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELLP55199 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELLP55199 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELLP55199 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELLP55199 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELLP55199 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELLP55199 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELLP55199 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELLP55199 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELLP55199 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELLP55199 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELLP55199 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELLP55199 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELLP55199 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELLP55199 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELLP55199 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELLP55199 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELLP55199 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ELLP55199 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELLP55199 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELLP55199 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELLP55199 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELLP55199 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELLP55199 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELLP55199 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELLP55199 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELLP55199 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ELLP55199 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELLP55199 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELLP55199 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELLP55199 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELLP55199 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELLP55199 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELLP55199 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELLP55199 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELLP55199 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ELLP55199 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELLP55199 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELLP55199 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELLP55199 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELLP55199 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELLP55199 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELLP55199 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELLP55199 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ELLP55199 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELLP55199 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELLP55199 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELLP55199 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELLP55199 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELLP55199 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELLP55199 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms