Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A1P52655 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms