Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR1P51861 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR1P51861 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR1P51861 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR1P51861 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDR1P51861 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDR1P51861 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDR1P51861 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDR1P51861 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDR1P51861 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDR1P51861 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDR1P51861 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDR1P51861 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDR1P51861 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDR1P51861 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDR1P51861 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDR1P51861 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDR1P51861 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDR1P51861 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDR1P51861 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDR1P51861 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDR1P51861 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDR1P51861 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDR1P51861 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDR1P51861 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDR1P51861 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDR1P51861 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDR1P51861 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDR1P51861 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDR1P51861 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDR1P51861 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDR1P51861 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDR1P51861 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDR1P51861 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDR1P51861 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDR1P51861 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDR1P51861 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDR1P51861 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDR1P51861 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDR1P51861 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDR1P51861 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDR1P51861 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDR1P51861 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR1P51861 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR1P51861 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR1P51861 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR1P51861 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR1P51861 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR1P51861 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR1P51861 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR1P51861 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR1P51861 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR1P51861 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR1P51861 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR1P51861 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR1P51861 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR1P51861 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR1P51861 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDR1P51861 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDR1P51861 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDR1P51861 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDR1P51861 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDR1P51861 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDR1P51861 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDR1P51861 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDR1P51861 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDR1P51861 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDR1P51861 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDR1P51861 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDR1P51861 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDR1P51861 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR1P51861 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR1P51861 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR1P51861 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR1P51861 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR1P51861 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR1P51861 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR1P51861 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR1P51861 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR1P51861 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR1P51861 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR1P51861 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR1P51861 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR1P51861 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDR1P51861 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDR1P51861 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDR1P51861 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDR1P51861 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDR1P51861 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDR1P51861 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDR1P51861 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDR1P51861 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDR1P51861 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDR1P51861 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDR1P51861 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDR1P51861 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDR1P51861 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDR1P51861 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDR1P51861 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDR1P51861 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms