Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLCSP50747 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLCSP50747 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLCSP50747 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLCSP50747 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLCSP50747 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLCSP50747 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLCSP50747 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLCSP50747 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLCSP50747 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HLCSP50747 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLCSP50747 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLCSP50747 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLCSP50747 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLCSP50747 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLCSP50747 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLCSP50747 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLCSP50747 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HLCSP50747 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLCSP50747 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLCSP50747 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLCSP50747 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLCSP50747 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLCSP50747 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLCSP50747 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLCSP50747 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLCSP50747 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLCSP50747 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLCSP50747 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLCSP50747 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLCSP50747 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLCSP50747 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLCSP50747 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLCSP50747 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLCSP50747 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLCSP50747 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLCSP50747 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLCSP50747 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLCSP50747 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLCSP50747 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLCSP50747 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLCSP50747 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLCSP50747 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HLCSP50747 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLCSP50747 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLCSP50747 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLCSP50747 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLCSP50747 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLCSP50747 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLCSP50747 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HLCSP50747 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLCSP50747 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLCSP50747 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLCSP50747 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HLCSP50747 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLCSP50747 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLCSP50747 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLCSP50747 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLCSP50747 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLCSP50747 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLCSP50747 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLCSP50747 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLCSP50747 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLCSP50747 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLCSP50747 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLCSP50747 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLCSP50747 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLCSP50747 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLCSP50747 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLCSP50747 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLCSP50747 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLCSP50747 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HLCSP50747 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLCSP50747 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HLCSP50747 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HLCSP50747 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HLCSP50747 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLCSP50747 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLCSP50747 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLCSP50747 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLCSP50747 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HLCSP50747 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLCSP50747 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLCSP50747 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLCSP50747 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLCSP50747 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLCSP50747 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLCSP50747 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLCSP50747 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLCSP50747 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLCSP50747 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLCSP50747 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLCSP50747 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HLCSP50747 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLCSP50747 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HLCSP50747 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLCSP50747 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLCSP50747 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLCSP50747 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLCSP50747 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms