Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME1P48163 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME1P48163 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME1P48163 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME1P48163 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME1P48163 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME1P48163 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME1P48163 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME1P48163 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME1P48163 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME1P48163 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME1P48163 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME1P48163 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME1P48163 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME1P48163 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME1P48163 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME1P48163 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME1P48163 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME1P48163 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ME1P48163 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ME1P48163 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ME1P48163 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ME1P48163 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ME1P48163 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ME1P48163 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ME1P48163 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ME1P48163 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ME1P48163 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ME1P48163 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME1P48163 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME1P48163 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME1P48163 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME1P48163 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME1P48163 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME1P48163 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME1P48163 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME1P48163 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME1P48163 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME1P48163 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME1P48163 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME1P48163 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME1P48163 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME1P48163 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME1P48163 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME1P48163 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME1P48163 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ME1P48163 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ME1P48163 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ME1P48163 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ME1P48163 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ME1P48163 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME1P48163 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME1P48163 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME1P48163 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME1P48163 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME1P48163 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME1P48163 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME1P48163 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME1P48163 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME1P48163 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ME1P48163 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME1P48163 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME1P48163 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME1P48163 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME1P48163 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME1P48163 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME1P48163 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ME1P48163 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ME1P48163 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ME1P48163 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ME1P48163 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ME1P48163 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ME1P48163 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ME1P48163 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ME1P48163 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ME1P48163 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ME1P48163 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ME1P48163 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ME1P48163 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ME1P48163 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ME1P48163 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ME1P48163 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ME1P48163 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ME1P48163 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ME1P48163 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ME1P48163 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ME1P48163 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ME1P48163 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ME1P48163 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ME1P48163 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ME1P48163 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME1P48163 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME1P48163 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME1P48163 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME1P48163 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME1P48163 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME1P48163 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME1P48163 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME1P48163 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME1P48163 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms