Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOP2P46087 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOP2P46087 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOP2P46087 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOP2P46087 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOP2P46087 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NOP2P46087 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOP2P46087 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOP2P46087 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOP2P46087 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOP2P46087 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOP2P46087 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOP2P46087 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOP2P46087 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOP2P46087 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOP2P46087 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOP2P46087 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOP2P46087 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOP2P46087 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOP2P46087 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOP2P46087 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOP2P46087 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOP2P46087 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOP2P46087 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOP2P46087 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOP2P46087 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOP2P46087 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOP2P46087 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOP2P46087 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NOP2P46087 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOP2P46087 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOP2P46087 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOP2P46087 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOP2P46087 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOP2P46087 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOP2P46087 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOP2P46087 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOP2P46087 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOP2P46087 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOP2P46087 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOP2P46087 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOP2P46087 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NOP2P46087 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOP2P46087 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOP2P46087 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOP2P46087 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOP2P46087 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOP2P46087 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOP2P46087 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOP2P46087 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOP2P46087 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOP2P46087 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOP2P46087 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOP2P46087 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOP2P46087 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOP2P46087 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NOP2P46087 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOP2P46087 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOP2P46087 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOP2P46087 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOP2P46087 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOP2P46087 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOP2P46087 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOP2P46087 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOP2P46087 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NOP2P46087 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOP2P46087 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOP2P46087 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOP2P46087 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOP2P46087 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOP2P46087 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NOP2P46087 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NOP2P46087 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NOP2P46087 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NOP2P46087 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NOP2P46087 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NOP2P46087 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NOP2P46087 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NOP2P46087 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NOP2P46087 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NOP2P46087 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOP2P46087 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOP2P46087 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOP2P46087 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOP2P46087 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOP2P46087 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOP2P46087 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOP2P46087 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOP2P46087 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOP2P46087 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOP2P46087 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOP2P46087 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOP2P46087 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOP2P46087 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NOP2P46087 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOP2P46087 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOP2P46087 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NOP2P46087 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOP2P46087 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOP2P46087 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms