Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACADSBP45954 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms