Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTGER3P43115 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms