Protein–RNA interactions for Protein: P41240

CSK, Tyrosine-protein kinase CSK, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSKP41240 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSKP41240 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSKP41240 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSKP41240 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSKP41240 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSKP41240 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSKP41240 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSKP41240 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSKP41240 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSKP41240 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSKP41240 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSKP41240 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSKP41240 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSKP41240 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSKP41240 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSKP41240 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSKP41240 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSKP41240 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSKP41240 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSKP41240 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSKP41240 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSKP41240 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSKP41240 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSKP41240 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSKP41240 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSKP41240 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSKP41240 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSKP41240 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSKP41240 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSKP41240 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSKP41240 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSKP41240 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSKP41240 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSKP41240 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSKP41240 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSKP41240 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSKP41240 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSKP41240 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSKP41240 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSKP41240 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSKP41240 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSKP41240 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSKP41240 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSKP41240 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSKP41240 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSKP41240 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSKP41240 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSKP41240 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSKP41240 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSKP41240 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSKP41240 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSKP41240 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSKP41240 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSKP41240 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSKP41240 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSKP41240 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSKP41240 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSKP41240 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSKP41240 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSKP41240 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSKP41240 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSKP41240 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSKP41240 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSKP41240 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSKP41240 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSKP41240 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSKP41240 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSKP41240 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSKP41240 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSKP41240 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSKP41240 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSKP41240 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSKP41240 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSKP41240 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSKP41240 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSKP41240 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSKP41240 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSKP41240 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSKP41240 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSKP41240 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CSKP41240 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSKP41240 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSKP41240 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSKP41240 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSKP41240 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSKP41240 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSKP41240 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSKP41240 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSKP41240 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSKP41240 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSKP41240 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSKP41240 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSKP41240 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSKP41240 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSKP41240 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSKP41240 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSKP41240 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSKP41240 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSKP41240 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSKP41240 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms