Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX19P40855 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX19P40855 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX19P40855 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX19P40855 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX19P40855 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX19P40855 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX19P40855 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX19P40855 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX19P40855 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX19P40855 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX19P40855 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX19P40855 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX19P40855 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX19P40855 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX19P40855 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX19P40855 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX19P40855 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX19P40855 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX19P40855 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX19P40855 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX19P40855 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX19P40855 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX19P40855 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX19P40855 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX19P40855 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX19P40855 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX19P40855 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX19P40855 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PEX19P40855 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PEX19P40855 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PEX19P40855 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PEX19P40855 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PEX19P40855 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PEX19P40855 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PEX19P40855 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PEX19P40855 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PEX19P40855 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PEX19P40855 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PEX19P40855 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PEX19P40855 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PEX19P40855 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PEX19P40855 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PEX19P40855 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PEX19P40855 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PEX19P40855 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PEX19P40855 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PEX19P40855 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PEX19P40855 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PEX19P40855 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PEX19P40855 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PEX19P40855 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PEX19P40855 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PEX19P40855 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PEX19P40855 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PEX19P40855 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PEX19P40855 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PEX19P40855 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PEX19P40855 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PEX19P40855 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PEX19P40855 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PEX19P40855 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PEX19P40855 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PEX19P40855 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEX19P40855 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEX19P40855 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEX19P40855 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX19P40855 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX19P40855 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX19P40855 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX19P40855 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEX19P40855 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEX19P40855 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PEX19P40855 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX19P40855 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX19P40855 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEX19P40855 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEX19P40855 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX19P40855 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEX19P40855 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEX19P40855 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX19P40855 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PEX19P40855 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX19P40855 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PEX19P40855 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX19P40855 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX19P40855 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX19P40855 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PEX19P40855 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PEX19P40855 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX19P40855 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX19P40855 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PEX19P40855 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PEX19P40855 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX19P40855 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PEX19P40855 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PEX19P40855 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PEX19P40855 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PEX19P40855 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PEX19P40855 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms