Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETFBP38117 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETFBP38117 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETFBP38117 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETFBP38117 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETFBP38117 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETFBP38117 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETFBP38117 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETFBP38117 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETFBP38117 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETFBP38117 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETFBP38117 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETFBP38117 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETFBP38117 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETFBP38117 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETFBP38117 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETFBP38117 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETFBP38117 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETFBP38117 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETFBP38117 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETFBP38117 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETFBP38117 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETFBP38117 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ETFBP38117 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETFBP38117 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ETFBP38117 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETFBP38117 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETFBP38117 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETFBP38117 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETFBP38117 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETFBP38117 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ETFBP38117 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETFBP38117 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ETFBP38117 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETFBP38117 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETFBP38117 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETFBP38117 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETFBP38117 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETFBP38117 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETFBP38117 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETFBP38117 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETFBP38117 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETFBP38117 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETFBP38117 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ETFBP38117 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ETFBP38117 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ETFBP38117 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ETFBP38117 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ETFBP38117 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETFBP38117 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETFBP38117 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETFBP38117 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETFBP38117 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ETFBP38117 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETFBP38117 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETFBP38117 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETFBP38117 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ETFBP38117 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ETFBP38117 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETFBP38117 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ETFBP38117 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETFBP38117 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETFBP38117 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETFBP38117 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETFBP38117 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETFBP38117 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETFBP38117 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETFBP38117 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETFBP38117 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETFBP38117 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETFBP38117 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETFBP38117 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETFBP38117 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETFBP38117 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETFBP38117 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETFBP38117 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETFBP38117 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ETFBP38117 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETFBP38117 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETFBP38117 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETFBP38117 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETFBP38117 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETFBP38117 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETFBP38117 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETFBP38117 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETFBP38117 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETFBP38117 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETFBP38117 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETFBP38117 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETFBP38117 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETFBP38117 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETFBP38117 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETFBP38117 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETFBP38117 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETFBP38117 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETFBP38117 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETFBP38117 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETFBP38117 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFBP38117 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFBP38117 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms