Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCAP37840 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCAP37840 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCAP37840 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCAP37840 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCAP37840 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCAP37840 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCAP37840 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCAP37840 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCAP37840 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCAP37840 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCAP37840 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCAP37840 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCAP37840 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCAP37840 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCAP37840 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCAP37840 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCAP37840 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCAP37840 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCAP37840 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCAP37840 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCAP37840 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCAP37840 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCAP37840 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCAP37840 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCAP37840 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCAP37840 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCAP37840 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCAP37840 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCAP37840 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCAP37840 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCAP37840 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCAP37840 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCAP37840 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCAP37840 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCAP37840 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCAP37840 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCAP37840 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCAP37840 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCAP37840 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCAP37840 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCAP37840 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCAP37840 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCAP37840 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCAP37840 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCAP37840 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCAP37840 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCAP37840 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCAP37840 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCAP37840 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCAP37840 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCAP37840 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCAP37840 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCAP37840 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCAP37840 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCAP37840 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCAP37840 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCAP37840 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNCAP37840 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNCAP37840 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCAP37840 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCAP37840 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCAP37840 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCAP37840 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCAP37840 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCAP37840 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCAP37840 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCAP37840 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCAP37840 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCAP37840 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCAP37840 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCAP37840 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCAP37840 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCAP37840 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCAP37840 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCAP37840 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCAP37840 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCAP37840 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCAP37840 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCAP37840 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCAP37840 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCAP37840 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCAP37840 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCAP37840 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCAP37840 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCAP37840 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCAP37840 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCAP37840 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCAP37840 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCAP37840 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCAP37840 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCAP37840 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCAP37840 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCAP37840 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCAP37840 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCAP37840 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCAP37840 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCAP37840 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCAP37840 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCAP37840 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms