Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SREBF1P36956 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms