Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MARCKSP29966 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms