Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms