Protein–RNA interactions for Protein: P26572

MGAT1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT1P26572 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGAT1P26572 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGAT1P26572 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGAT1P26572 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGAT1P26572 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGAT1P26572 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGAT1P26572 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGAT1P26572 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGAT1P26572 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGAT1P26572 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGAT1P26572 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGAT1P26572 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGAT1P26572 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGAT1P26572 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGAT1P26572 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGAT1P26572 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGAT1P26572 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGAT1P26572 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGAT1P26572 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MGAT1P26572 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MGAT1P26572 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MGAT1P26572 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MGAT1P26572 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms