Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms