Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPAP23025 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPAP23025 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPAP23025 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPAP23025 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPAP23025 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
XPAP23025 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
XPAP23025 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPAP23025 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPAP23025 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
XPAP23025 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPAP23025 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPAP23025 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPAP23025 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPAP23025 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPAP23025 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPAP23025 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPAP23025 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
XPAP23025 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPAP23025 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPAP23025 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPAP23025 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPAP23025 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPAP23025 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPAP23025 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPAP23025 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPAP23025 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPAP23025 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPAP23025 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPAP23025 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
XPAP23025 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPAP23025 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
XPAP23025 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPAP23025 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPAP23025 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPAP23025 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPAP23025 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPAP23025 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPAP23025 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPAP23025 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPAP23025 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPAP23025 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPAP23025 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPAP23025 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPAP23025 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPAP23025 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPAP23025 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPAP23025 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPAP23025 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPAP23025 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPAP23025 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPAP23025 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPAP23025 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPAP23025 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPAP23025 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPAP23025 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
XPAP23025 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
XPAP23025 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPAP23025 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPAP23025 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPAP23025 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XPAP23025 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPAP23025 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPAP23025 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPAP23025 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPAP23025 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPAP23025 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPAP23025 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPAP23025 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPAP23025 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPAP23025 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPAP23025 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPAP23025 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPAP23025 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPAP23025 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPAP23025 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPAP23025 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XPAP23025 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPAP23025 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPAP23025 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPAP23025 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XPAP23025 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPAP23025 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPAP23025 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPAP23025 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPAP23025 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPAP23025 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPAP23025 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPAP23025 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPAP23025 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPAP23025 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPAP23025 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
XPAP23025 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPAP23025 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPAP23025 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPAP23025 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPAP23025 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPAP23025 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPAP23025 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPAP23025 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms