Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms