Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA2P17301 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA2P17301 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms