Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STMN1P16949 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STMN1P16949 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STMN1P16949 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STMN1P16949 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STMN1P16949 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STMN1P16949 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STMN1P16949 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STMN1P16949 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STMN1P16949 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STMN1P16949 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
STMN1P16949 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STMN1P16949 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STMN1P16949 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STMN1P16949 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STMN1P16949 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STMN1P16949 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STMN1P16949 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STMN1P16949 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STMN1P16949 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STMN1P16949 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STMN1P16949 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STMN1P16949 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STMN1P16949 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STMN1P16949 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STMN1P16949 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STMN1P16949 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STMN1P16949 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STMN1P16949 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STMN1P16949 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STMN1P16949 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STMN1P16949 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STMN1P16949 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STMN1P16949 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STMN1P16949 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
STMN1P16949 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STMN1P16949 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STMN1P16949 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STMN1P16949 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STMN1P16949 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STMN1P16949 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
STMN1P16949 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STMN1P16949 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STMN1P16949 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STMN1P16949 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
STMN1P16949 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STMN1P16949 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STMN1P16949 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STMN1P16949 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STMN1P16949 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STMN1P16949 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STMN1P16949 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STMN1P16949 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STMN1P16949 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
STMN1P16949 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STMN1P16949 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STMN1P16949 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STMN1P16949 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
STMN1P16949 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STMN1P16949 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STMN1P16949 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
STMN1P16949 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STMN1P16949 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
STMN1P16949 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
STMN1P16949 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STMN1P16949 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STMN1P16949 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STMN1P16949 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STMN1P16949 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STMN1P16949 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STMN1P16949 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STMN1P16949 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STMN1P16949 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STMN1P16949 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STMN1P16949 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STMN1P16949 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STMN1P16949 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STMN1P16949 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STMN1P16949 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STMN1P16949 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STMN1P16949 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22■■□□□ 1.11
STMN1P16949 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STMN1P16949 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STMN1P16949 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STMN1P16949 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STMN1P16949 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STMN1P16949 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STMN1P16949 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STMN1P16949 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STMN1P16949 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STMN1P16949 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STMN1P16949 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STMN1P16949 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STMN1P16949 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STMN1P16949 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STMN1P16949 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STMN1P16949 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STMN1P16949 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STMN1P16949 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STMN1P16949 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms