Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms