Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLS3P13797 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PLS3P13797 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLS3P13797 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLS3P13797 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLS3P13797 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLS3P13797 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLS3P13797 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLS3P13797 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLS3P13797 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLS3P13797 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLS3P13797 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLS3P13797 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLS3P13797 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLS3P13797 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLS3P13797 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLS3P13797 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLS3P13797 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLS3P13797 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLS3P13797 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLS3P13797 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLS3P13797 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLS3P13797 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLS3P13797 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLS3P13797 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLS3P13797 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLS3P13797 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLS3P13797 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLS3P13797 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLS3P13797 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLS3P13797 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLS3P13797 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLS3P13797 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLS3P13797 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLS3P13797 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLS3P13797 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLS3P13797 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PLS3P13797 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLS3P13797 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLS3P13797 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLS3P13797 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLS3P13797 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLS3P13797 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLS3P13797 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLS3P13797 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLS3P13797 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLS3P13797 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLS3P13797 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLS3P13797 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLS3P13797 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLS3P13797 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLS3P13797 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLS3P13797 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLS3P13797 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLS3P13797 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLS3P13797 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLS3P13797 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLS3P13797 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLS3P13797 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLS3P13797 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLS3P13797 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLS3P13797 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLS3P13797 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLS3P13797 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLS3P13797 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLS3P13797 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PLS3P13797 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PLS3P13797 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLS3P13797 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLS3P13797 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLS3P13797 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLS3P13797 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLS3P13797 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLS3P13797 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLS3P13797 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLS3P13797 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLS3P13797 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLS3P13797 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLS3P13797 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLS3P13797 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLS3P13797 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLS3P13797 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLS3P13797 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLS3P13797 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLS3P13797 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLS3P13797 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLS3P13797 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLS3P13797 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PLS3P13797 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLS3P13797 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PLS3P13797 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLS3P13797 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLS3P13797 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLS3P13797 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLS3P13797 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLS3P13797 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLS3P13797 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLS3P13797 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLS3P13797 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLS3P13797 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms