Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RALAP11233 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RALAP11233 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RALAP11233 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RALAP11233 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RALAP11233 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RALAP11233 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RALAP11233 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RALAP11233 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALAP11233 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALAP11233 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALAP11233 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALAP11233 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALAP11233 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALAP11233 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALAP11233 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RALAP11233 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALAP11233 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALAP11233 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALAP11233 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALAP11233 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RALAP11233 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALAP11233 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALAP11233 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RALAP11233 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALAP11233 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALAP11233 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALAP11233 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RALAP11233 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RALAP11233 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RALAP11233 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RALAP11233 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RALAP11233 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RALAP11233 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RALAP11233 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RALAP11233 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RALAP11233 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RALAP11233 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RALAP11233 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RALAP11233 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RALAP11233 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RALAP11233 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RALAP11233 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RALAP11233 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RALAP11233 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RALAP11233 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RALAP11233 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RALAP11233 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RALAP11233 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RALAP11233 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RALAP11233 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RALAP11233 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RALAP11233 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RALAP11233 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RALAP11233 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RALAP11233 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RALAP11233 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RALAP11233 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RALAP11233 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RALAP11233 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RALAP11233 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RALAP11233 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RALAP11233 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RALAP11233 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RALAP11233 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RALAP11233 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RALAP11233 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RALAP11233 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RALAP11233 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RALAP11233 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RALAP11233 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RALAP11233 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RALAP11233 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RALAP11233 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RALAP11233 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RALAP11233 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RALAP11233 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RALAP11233 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RALAP11233 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RALAP11233 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RALAP11233 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RALAP11233 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RALAP11233 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RALAP11233 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RALAP11233 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RALAP11233 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RALAP11233 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RALAP11233 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RALAP11233 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RALAP11233 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RALAP11233 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RALAP11233 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RALAP11233 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RALAP11233 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RALAP11233 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RALAP11233 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RALAP11233 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RALAP11233 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RALAP11233 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RALAP11233 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms