Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD8BP10966 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD8BP10966 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD8BP10966 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD8BP10966 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD8BP10966 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD8BP10966 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD8BP10966 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD8BP10966 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD8BP10966 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD8BP10966 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD8BP10966 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD8BP10966 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD8BP10966 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD8BP10966 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD8BP10966 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD8BP10966 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD8BP10966 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD8BP10966 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CD8BP10966 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CD8BP10966 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CD8BP10966 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD8BP10966 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD8BP10966 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD8BP10966 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD8BP10966 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD8BP10966 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD8BP10966 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8BP10966 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8BP10966 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8BP10966 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8BP10966 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8BP10966 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8BP10966 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8BP10966 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8BP10966 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8BP10966 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8BP10966 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8BP10966 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8BP10966 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8BP10966 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8BP10966 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8BP10966 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8BP10966 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8BP10966 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8BP10966 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8BP10966 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD8BP10966 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD8BP10966 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD8BP10966 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD8BP10966 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD8BP10966 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD8BP10966 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD8BP10966 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD8BP10966 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD8BP10966 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD8BP10966 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8BP10966 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8BP10966 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8BP10966 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8BP10966 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8BP10966 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8BP10966 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8BP10966 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8BP10966 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8BP10966 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8BP10966 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8BP10966 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8BP10966 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8BP10966 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8BP10966 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8BP10966 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8BP10966 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8BP10966 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms