Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMIM17P0DL12 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms