Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L7P0C7H9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L7P0C7H9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L7P0C7H9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L7P0C7H9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L7P0C7H9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms