Protein–RNA interactions for Protein: P05771

PRKCB, Protein kinase C beta type, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCBP05771 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCBP05771 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms