Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAP2AP05549 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAP2AP05549 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms