Protein–RNA interactions for Protein: O95274

LYPD3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD3O95274 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYPD3O95274 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LYPD3O95274 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LYPD3O95274 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LYPD3O95274 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LYPD3O95274 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYPD3O95274 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYPD3O95274 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYPD3O95274 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms