Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAF4O95104 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAF4O95104 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms