Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms