Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
VAMP4O75379 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VAMP4O75379 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms