Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8B3O60423 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms