Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PLIN1O60240 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLIN1O60240 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLIN1O60240 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms