Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXTL3O43909 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms