Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HTATSF1O43719 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms