Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSI1O43347 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSI1O43347 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSI1O43347 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSI1O43347 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSI1O43347 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSI1O43347 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSI1O43347 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSI1O43347 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSI1O43347 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSI1O43347 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MSI1O43347 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSI1O43347 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSI1O43347 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSI1O43347 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSI1O43347 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSI1O43347 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSI1O43347 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSI1O43347 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSI1O43347 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSI1O43347 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSI1O43347 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSI1O43347 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSI1O43347 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSI1O43347 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MSI1O43347 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSI1O43347 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSI1O43347 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSI1O43347 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSI1O43347 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSI1O43347 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSI1O43347 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSI1O43347 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSI1O43347 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSI1O43347 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSI1O43347 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MSI1O43347 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MSI1O43347 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSI1O43347 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSI1O43347 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSI1O43347 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSI1O43347 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSI1O43347 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSI1O43347 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSI1O43347 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSI1O43347 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MSI1O43347 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSI1O43347 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSI1O43347 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSI1O43347 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSI1O43347 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSI1O43347 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSI1O43347 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSI1O43347 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSI1O43347 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSI1O43347 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSI1O43347 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSI1O43347 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MSI1O43347 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MSI1O43347 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSI1O43347 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSI1O43347 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSI1O43347 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSI1O43347 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MSI1O43347 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSI1O43347 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSI1O43347 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSI1O43347 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSI1O43347 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSI1O43347 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSI1O43347 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSI1O43347 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSI1O43347 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSI1O43347 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSI1O43347 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSI1O43347 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSI1O43347 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSI1O43347 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MSI1O43347 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MSI1O43347 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MSI1O43347 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MSI1O43347 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSI1O43347 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MSI1O43347 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSI1O43347 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSI1O43347 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSI1O43347 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MSI1O43347 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MSI1O43347 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSI1O43347 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSI1O43347 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSI1O43347 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSI1O43347 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSI1O43347 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSI1O43347 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSI1O43347 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSI1O43347 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSI1O43347 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSI1O43347 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSI1O43347 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms